В конце 2015 года, специалистами владимирской группы отдела селекции ВНИИ коневодства были проведены уникальные для отечественных пород лошадей генетические исследования. В работе были использованы современные методы молекулярной генетики, открывающие возможность изучения внеядерной наследственности, присущей всем живым организмам.

В результате изучения полиморфизмов D-петли митохондриальной ДНК представителей владимирской породы лошадей, была установлена генетическая неоднородность, наблюдавшаяся в некоторых сегментах генеалогической структуры породы. Полученные данные значительно расширили знания о женских линиях и указали на наличие дополнительных резервов генетического разнообразия, скрытых в обособленности происхождения современных маточных семейств.

Исследователями было установлено, что во владимирской породе насчитывается 24 маточных семейства, а не 21, как предполагалось ранее. С обновлённой структурой маточных семейств можно ознакомиться на странице генеалогических схем в разделе «О породе».